Aquesta vegada Mario, Donkey Kong i Sonic s'uniran per tal de resoldre el trencaclosques que han creat els seus enemics. Cada personatge té la seva pròpia habilitat i poder. Mario té el poder de desplaçar un objecte. Donkey Kong té la capacitat d'explotar en impactar. Finalment, Sonic té elasticitat per rebotar per tot arreu. Usa cada personatge amb prudència per resoldre el trencaclosques. Utilitza el ratolí per triar i col·locar la bola en el lloc adequat.